qué es el e value

El e-value (Expect) es el número de alineamientos que esperamos para una puntuación (score) X (o superior) en la búsqueda que estamos realizando si la base de datos fuese una colección de letras al azar. ... El número de alineamientos con un score > S se incrementa linealmente con el tamaño de la base de datos.

De igual forma, ¿qué es el valor E en un Blast?

El valor e-value dado por el blast depende de la base de datos empleada y de la longitud de la secuencia. El número de alineamientos con un score > S se incrementa linealmente con el tamaño de la base de datos.

De igual forma, ¿qué es Query cover?

Query cover: el porcentaje de la secuencia del Query que cubre la alineación con la Referencia. E-value: el valor esperado que se calcula a partir de la puntuación máxima (es decir, se esperaría ver esta alineación por razones aleatorias con una frecuencia del valor indicado)

Así, ¿cómo se usa el Blast?

Normalmente el BLAST es usado para encontrar probables genes homólogos. Por lo general, cuando una nueva secuencia es obtenida, se usa el BLAST para compararla con otras secuencias que han sido previamente caracterizadas, para así poder inferir su función.